蒲生贤秀、后藤高治、平井定武、高野濑秀隆、山崎片家、小仓实澄、池田景雄、布施公保等南近江诸将才投效上杉家不久，尚未立下任何功绩。为了能够获得上杉家的信赖和重用，他们自然不打算对百济寺手下留情。
而八条春纲作为大将也默许了南近江诸将对百济寺烧讨的行为。
在八条春纲看来，不论是寺院还是神社皆改变不了天下大势的进展。如果求神拜佛就能往生极乐的话，这世间就能长久泰平，不会再有兵燹、天灾之祸了······
永禄元年，伪朝如意二年，九月十日。
此时本应是百济寺最佳的赏枫时节，可百济寺上下僧众就没有赏枫的心情和机会了。
作为近江土生土长的南近江诸将对百济寺周边地理是再熟悉不过，加上他们还时常前去参谒，就算是闭着眼都能走到佛殿之中。
百济寺僧众终究没有一向一揆众那般狂热，更不像延历寺、平泉寺等豢养数千僧兵的寺院，哪里是如狼似虎的上杉军对手。
仅仅不到半个时辰的时间，上杉军蒲生贤秀部便攻破了仁王门。
作为百济寺住持的离相庵将鹤只能眼睁睁看着百济寺大量宿坊、佛塔、伽蓝等被烧毁，大量僧众被杀。他完全没有料到上杉家竟然会真的攻打有着天台别院之称的百济寺。
重重宝殿，处处寺社，红红的星飞迸散，腾腾的焰接林梢，烘烘的火闭山门。
很快，哭喊声、哀叫声、呻吟声、咒骂声是不绝于耳，进而响彻山谷。
高僧、长老、僧兵等百济寺上下僧众就像炼狱之中的蚂蚁一般，四处逃窜，不知所措。
可百济寺所在的释迦山周边早就被上杉军围了个水泄不通，使得百济寺的僧众完全无路可逃。
最终，百济寺自住持离相庵将鹤以下八百余僧众不分老幼尽数被杀，就连周边的一千余座宿坊也被波及烧毁，无一幸免。
只有百济寺供奉的本尊十一面观音（植木观音）幸免于难，而后还被蒲生贤秀移至释迦山最北面的奥之院中。
战后，蒲生贤秀因烧讨百济寺表现活跃，不仅获得一千石百济寺寺领的加封，成为参阵诸将之中瓜分百济寺寺领最多的人。而且，他还被清定表奏担任从五位上左兵卫佐的官位。
可以说，蒲生贤秀是踩着百济寺僧众的尸骨飞黄腾达的。
正所谓天道好轮回，苍天饶过谁，万般皆是命，半点不由人。